Friedrich war das einzige ehelich geborene Kind des Fürsten Leopold III. von Anhalt-Dessau (1740–1817) aus dessen Ehe mit Luise (1750–1811), Tochter des Markgrafen Friedrich Heinrich von Brandenburg-Schwedt. Aus dem Erbe seiner Mutter erhielt Friedrich die brandenburgischen Güter Stolzenberg, Wormsfelde und Zantoch, die damit an das Haus Anhalt-Dessau kamen.

Ab 1788 war er Offizier in preußischen Diensten, aus dem er Anfang Januar 1794 unter Beförderung zum Generalmajor und Verleihung des Schwarzer Adlerordens entlassen wurde. Friedrich, der nie an der Regierung Anhalts beteiligt, starb drei Jahre vor seinem Vater, weshalb diesem Friedrichs ältester Sohn als Fürst von Anhalt-Dessau folgte.

In Friedrichs Auftrag begann ab 1805 die Gestaltung des Kühnauer Parks.

Kinder:

• Auguste (1793–1854)
  
• Leopold IV. Friedrich (1794–1871), Herzog von Anhalt
  
• Georg (1796–1865)
  
• Paul (*/† 1797)
  
• Luise (1798–1858)
  
• Friedrich August (1799–1864)
  
• Wilhelm (1807–1864)

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